精子的畸形率达到了99%是很严重的，建议多复查2-3次精液常规，如果结果相同，有以下建议：
第一、积极的参加体育锻炼活动，增强体质。
第二、从生活习惯上做重大的调整，比如忌烟、忌酒，低盐、低脂饮食，控制体重，多摄入蔬菜、瓜果、纤维，补充体内必要的维生素和微量元素。
第三、调节情绪、心态，改变精神面貌，保持积极向上、乐观的心情状态。同时再辅助使用雄激素，口服雄激素、维生素E以及磷酸二酯酶抑制剂，比如枸橼酸西地那非片，同时辅助使用中成药，比如六味地黄丸。通过综合治疗观察2-3个月，再复查精液常规。
如果有效果可以继续，如果精子的畸形率变化恢复不明显，建议尽早去生殖医学科就诊，了解有没有辅助生殖的可能性。
第一、积极的参加体育锻炼活动，增强体质。
第二、从生活习惯上做重大的调整，比如忌烟、忌酒，低盐、低脂饮食，控制体重，多摄入蔬菜、瓜果、纤维，补充体内必要的维生素和微量元素。
第三、调节情绪、心态，改变精神面貌，保持积极向上、乐观的心情状态。同时再辅助使用雄激素，口服雄激素、维生素E以及磷酸二酯酶抑制剂，比如枸橼酸西地那非片，同时辅助使用中成药，比如六味地黄丸。通过综合治疗观察2-3个月，再复查精液常规。
如果有效果可以继续，如果精子的畸形率变化恢复不明显，建议尽早去生殖医学科就诊，了解有没有辅助生殖的可能性。