由于偏头痛的病因和诱发因素不同，如果在去除了偏头痛的主要诱发因素后，偏头痛可以不再复发，这个时候可以说是自愈，比如有的患者偏头痛发作可能就是跟失眠、疲劳有关，患者在改善了睡眠之后偏头痛不再发作了，就是偏头痛自愈。再比如部分女性患者在绝经之后偏头痛也不发作，这个也称为偏头痛自愈。当然也有部分偏头痛跟基因遗传相关，基因不能改变，所以这种类型的偏头痛就无法根治，但可以用药物有效控制它的发作。
临床上常常听到很多患者和医生提到血管神经性头痛，实际上在国际头痛分类里面已经没有这么一个名称，原来的血管神经性头痛现在多数时候指的是偏头痛。 从医学上而言，由于偏头痛的发病机制还不十分明确，所以目前没有根治的药物，但药物可以减轻或终止头痛发作，预防头痛复发。
尽管部分偏头痛不能根治，但大多数偏头痛的预后还很好。所以得了偏头痛也不用过于担心，可以积极去找到诱发偏头痛的诱因，比如是否跟一些食物药物有关、是否和天气、睡眠、情绪等因素有关，然后尽量避免这些诱因，这对于偏头痛的自愈都有一定的帮助。对于一些没有明显诱因的偏头痛，可以配合药物治疗也能控制发作。随着年龄的增长，大部分患者症状都会减轻，或者停止发作。