子宫内膜异位性不孕可以治疗，因为内异病灶会对卵巢组织产生一定破坏，可以影响正常排卵同时引起周围组织及器官粘连，盆腔内膜异位结节分泌前列腺素等因子，影响输卵管正常拾卵和子宫内膜容受性导致不孕。子宫内膜异位症合并不孕患者，治疗方法主要包括药物治疗和手术治疗，一般是腹腔镜手术行巧囊剥除、内膜异位灶电灼术、输卵管修复整形、盆腔粘连松解等，手术后受孕率一般在50%左右。
对有迫切生育要求的子宫内膜异位症术后患者不采用GnRHa抑制排卵，选择中西医结合治疗方法，采用中药口服及药物保留灌肠、治疗仪等外治法治疗，既能预防子宫内膜异位灶复发，又能促进输卵管功能恢复，增加子宫内膜容受性，自然术后受孕率比单纯手术患者受孕率高。如果手术后积极试孕0.5-1年还没有怀孕的患者，可以建议采取人工授精或试管婴儿等辅助生殖方式助孕。