慢性肾功能衰竭早期通常无明显症状，多数患者仅表现为单纯乏力、腰痛、食欲下降、浮肿。但随慢性肾功能衰竭进展，血肌酐水平升高，体内毒素可以逐渐蓄积。毒素聚集到一定程度时可引起多脏器损伤，例如血液系统可引起肾性贫血发生，出现贫血相关临床表现；消化道症状可出现较严重恶心、呕吐、无法进食；毒素在皮肤沉积时多数患者可出现皮肤瘙痒症状；尿毒症毒素累及神经系统时可出现头痛、头晕、血压升高，严重可诱发癫痫发作。
此外，慢性肾功能衰竭后期可出现水、电、酸碱平衡紊乱，以及一系列并发症。例如水分无法排出可出现心力衰竭临床表现，毒素在心脏沉积可导致尿毒症 心肌损伤，还可出现高钾血症对应临床表现等。