儿童EB病毒感染最常见的是传染性单核细胞增多症，表现主要为急性发热、咽喉痛、扁桃体化脓、颈部浅表淋巴结肿大、肝脾肿大等。病情严重可以引起嗜血细胞综合征而危及生命，这时表现往往以发烧难以控制，感染中毒症状可非常重。血常规中白细胞、红细胞、血小板等都可明显减少，可以危及患儿生命安全。EB病毒感染一般在急性感染期控制以后呈慢性感染状态，所以平时需要加强体质，避免感冒，以免激活体内潜伏的EB病毒。
EB病毒可以治愈，但并不是所有EB病毒都可能治愈，只是绝大多数人群可能通过自身免疫力、自身免疫抵抗EB病毒恶化。EB病毒感染后引起的传染性单核细胞增多症具有自限性，出现症状后数周内会减轻，直到症状消失。但EB病毒会以潜伏形式存在于体内。对于少数EB病毒引起的传染性单核细胞增多症，症状较重患者，比如引起发热、神经系统疾病、淋巴结肿大、肝脾大、肝功能异常患者，往往需要通过对症支持治疗控制并发症症状。如果为免疫缺陷儿童感染EB病毒，病死率甚至高达60%，需要正确就医。