目前慢性肺炎的定义在临床没有达成共识，如果将慢性肺炎界定为各种原因导致的肺炎超过3个月没有痊愈，治疗主要有以下几点：
1、根据肺炎经久不愈的原因，判断是何种病原菌没有被所用的抗生素覆盖。真菌感染较难被检出，经久不愈，全身炎症反应不重，可导致脏器功能衰竭，发展速度比较慢的病原体通常是真菌感染。因此经久不愈的肺炎，如无法排除可能有真菌感染，尤其是耐药的真菌感染，必要时可经验性给予抗真菌治疗，可以用除氟康唑以外，对耐药的真菌有效的药物，如伏立康唑、科赛斯、伊曲康唑等；
2、经久不愈的肺炎与咳嗽、排痰、引流不通畅有关，慢性肺炎患者要加强翻身、拍背、咳嗽、排痰，使痰液引流通畅，这类做法有利于治疗肺炎；
3、加强患者的营养支持，营养支持对于抗感染治疗十分重要。必要时，可使用增强机体免疫力的药物，如增强体液免疫的免疫球蛋白，增强细胞免疫的胸腺肽等。