药物流产吃米非司酮时，基本上不疼，吃米索前列醇会疼。米索前列醇促进子宫收缩，使胎囊排下来。一般药物有3个小时的作用，如果3个小时排出来了，就不疼了。如果没有排下来，可能还要再吃一次，可能又有3个小时刺激子宫收缩，所以疼一般就是这几个小时。如果疼了6个小时还没下来，可能就需要做刮宫手术了，就不是单纯的药物流产，所以大概的时间就是6个小时。
刚开始吃米非司酮的过程中间不疼，也许有一点小小的出血，基本上都不疼。如果吃米索前列醇，刺激子宫收缩，有的人可能会疼痛很厉害，甚至可能还会有恶心、呕吐。大多数没有那么难受，可以喝点热水、稍微走动，可能能缓解疼痛。如果吃止疼药，其实效果并不是特别好。坐着或者躺着，喝一点热水，然后等待，也可以散步，会帮助药物能够快速起效，胎囊能够迅速排出，排出以后基本就不疼了。