肾结石与肾囊肿是不同的疾病，治疗的方式和方法也完全不相同，所以应该分别、分类进行对待。肾结石的治疗取决于结石大小、结石数量，以及结石是否引起相应的并发症，从而采取不同的治疗方案，具体如下：
1、无需治疗：肾结石直径在6mm以内或者更小的结石，如果没有明显的症状和并发症，通常不需要特殊治疗，患者只需要注意平常多运动、多饮水，结石都能够自行排出体外；
2、观察：肾结石直径>0.6-1cm结石，如果为单发结石，而且结石也没有导致患者出现明显的症状，没有引起积水，患者也可以选择观察，可以不用治疗；
3、体外冲击波 碎石：肾结石直径为0.6-1cm，但是出现肾积水症状，可以采取体外冲击波碎石进行治疗；
4、软镜输尿管碎石：肾结石直径为1-2cm，可以通过输尿管软镜碎石取石；
5、经皮肾镜碎石：肾结石>2cm，或者数量再多的结石，可以通过经皮肾镜进行碎石。
而肾囊肿治疗，如果体积比较小，比如直径在4cm以内，一般不需要特殊治疗。当肾囊肿的体积>4cm以上，或者囊肿位于肾盂输尿管连接部出现梗阻症状时，或者肾囊肿合并感染、出血等显著症状，就需要采用穿刺硬化，或者是腹腔镜的肾囊肿去顶减压手术进行治疗。