泌尿系统结核主要根据结核进展情况选择合理治疗，具体治疗如下：
1、药物治疗：目前最常用的药物是利福平、雷米封、吡嗪酰胺等。通过此类药物组合达到控制结核的目的，通常治疗周期为6-9个月。而通过抗结核治疗达到治愈结核并保存肾脏的目的，仅适用于极早期的肾结核。因此临床上通过抗结核治疗，达到保肾目的的机会并不多。结核早期症状较隐匿，等明确诊断后，通常已达到一定进展；
2、手术治疗：肾结核发生后要进行评估，手术治疗前进行抗结核的处理。通过2周以上的抗结核治疗后，再进行肾脏的切除手术。还应对结核所引起的并发问题进行处理，临床上最常见的并发问题为挛缩膀胱，患者会出现严重的尿频、尿急。此时可以根据情况选择膀胱扩大手术，改善排尿的刺激症状。