胆汁反流性胃炎较难治愈。胆汁反流性胃炎从病因上分为器质性原因以及功能性胆汁反流。器质性原因主要见于胆系疾病，如胆囊结石、胆管结石等，这一类患者往往存在胆汁分泌不协调而导致有毒性胆汁酸成分增加，从而导致损害胃黏膜。建议口服熊去氧胆酸调节胆汁分泌，减少有毒性胆汁酸对胃黏膜造成的损害。因胆结石发病原因很多，也很复杂，很难从根本上去除胆结石发病原因。胆结石不能根治，胆汁反流性胃炎也就很难去除。功能性原因多见于青年人，往往是因为胃窦、幽门括约肌、十二指肠蠕动不协调造成的胆汁反流。
患者需三餐规律、劳逸结合、避免精神压力过大。在症状比较严重时可口服中和胆汁药物，保护胃黏膜，再口服促进胃动力药物，使胆汁尽快向下转移，而不反流到胃中。