藿香正气水一般应该在饭后服用，而不应该在饭前服用。藿香正气是相对比较有名的中药方剂，主要具有解表、化湿的作用，可以用于治疗外感寒邪、内伤湿滞的表现，例如胸脘满闷、头晕、头昏、恶心、呕吐以及腹泻等，夏季最炎热时受风寒之邪所出现的一系列的症状。藿香正气水是在藿香正气自然组方的基础上，加入一定的乙醇，乙醇的味道比较浓烈，部分人服用藿香正气水后，会感觉胃中有较强的烧灼感，对胃肠道形成相对明显的刺激作用。
因此按照中药的服药方法，一般对于胃有刺激性的药物应放到饭后进行服用。如果是急性病症，藿香正气水可以在饭前喝，但如果不是急症，按照中医的理论，作为可以刺激胃的藿香正气水，建议在饭后服用，以避免藿香正气水对胃肠道的刺激作用。