甲状舌骨囊肿术后要保持切口的清洁、干燥，及时的换药，更换引流条。如果伤口不深，也可以不用放置引流条。对孩子的呼吸、生命体征的一般观察，由于甲状舌骨囊肿为气管的前方，出血有可能会压迫到气管，造成呼吸的困难。这个时候一定要在床旁放一个气切包，来保证安全期的度过。
在术后的24小时内是危险的情况，这个时候要密切注意切口引流量的变化，注意生命体征的变化，当度过这个时候，一般情况就不大了。术后再经过2-3次的换药，一周左右就可以拆线，拆线之后就可以回家。术后可以三个月以后来定期复查B超，基本上也就结束治疗过程。