先天性巨结肠跟肛肠畸形不是同一种病，具体区别如下： 1、肛肠畸形一般在小儿外科临床上指肛门闭锁这类患儿，即出生以后没有肛门称为肛肠畸形，归为肝肠畸形里。肛肠畸形是肛门闭锁，这种患儿肛门括约肌都没发育好，要做肛门成形，有的患者甚至要做括约肌成形。这种患儿如果是高位锁肛，术后会影响肛门括约肌功能，对以后排便影响较大； 2、先天性巨结肠属于肠道疾病。

尿道下裂是先天畸形，发病原因不明。患儿先天性畸形发育过程主要与内分泌系统有关，男孩、女孩发育不同。男童阴茎发育需要雄激素，正常儿童的内分泌系统包括大脑下丘脑、垂体以及雄性激素下的内分泌轴，如果这个系统出现问题，会影响阴茎的发育。 如果胚胎在妈妈肚子里，胚胎发育的微环境对其也有影响，比如妈妈用雌激素类药物。如果尿道下裂的患儿基因有问题，某些基因位点跟尿道下裂也有关系。

先天性巨结肠手术是大手术，按照手术大小分类是Ⅳ类手术，肯定有危险。具体情况如下： 1、如果患儿是新生儿、疾病较重，肠梗阻严重，又有并发症，相当于病患有小肠结肠炎，有的患儿并发为肠穿孔、弥漫性腹膜炎，手术相对较危险。若巨结肠患儿便秘较严重，治疗时一时解除不了肠梗阻，有的患儿并发肠梗阻，出现肠穿孔、肠穿孔、腹膜炎，这种患儿就较危险。这时患儿只能先造瘘，度过危险期，改善营养状况后再做二期手术； 2、如果是普通患儿，小时候护理较好，在新生儿就可以有条件做手术，这种患儿没有出现并发症的情况下，手术较安全。