巧囊会癌变，也就是越大的巧囊越易出现恶变，出现恶变和容易出现恶变是两个概念，但巧囊发生恶变几率很低。在现在的就诊条件下，定期随访就可以防止巧囊进一步的发展。 如果发现巧囊在短时间内迅速长大或出现其它临床症状，就要进行积极的手术治疗和手术干预，并不是出现巧囊就一味的观察，要根据巧囊发展的情况进行处理。所以巧囊会有一定恶变率，需要警惕。

子宫内膜异位症根据发病的不同部位，症状不同，如果长在卵巢上，称为巧克力囊肿；如果在腹膜里或在重要器官和植入点里出现结节，称为深部内膜异位症。深部内膜异位症，虽然结节很小，但有症状还是要进行手术，如果卵巢囊肿长到4-5cm，则会引起不孕，也要手术。如果囊肿2-3cm，且没有任何症状，没有生育要求，患者年龄在35岁以下，可用药物进行处理。 不是所有囊肿都需处理，要因囊肿大小、性质、症状以及要求、年龄，进行不同处理，即便做完手术后的巧克力囊肿，还要长期管理，并不是做完巧克力囊肿后就一劳永逸，巧克力囊肿容易复发。

做完子宫内膜异位症手术后，如果是做深部内异症切除手术，一般切除干净后，后续治疗相对较少，但并不是不管。如果40岁以前要口服避孕药，抑制内膜异位症复发，如果有吸烟史，35岁以后不主张再口服避孕药，可以应用其它药物，如地诺孕素或曼月乐环都可以较好控制和抑制内异症复发。 如果是巧囊，在卵巢上囊肿，如果评分超过Ⅲ期和Ⅳ期，建议做完手术后进行药物治疗，服用地诺孕素，也可以打针，如果有生育要求，在治疗结束后马上试孕。所以不同的疾病，不同的治疗，也会有不同的后续治疗，并不是做完手术即可。